游戏分为四个世界,一共108个关卡,除了第一个世界之外,后面三个世界都有让你琢磨不透的物理特性。第一个世界为普通世界,只需要通过基本操作就可过关。第二个世界中加入了风一样的效果,当Cyto触碰到时,就会随着慢慢飘走。第三个为黑洞世界,Cyto会在这个关卡中穿梭无数个黑洞。第四个世界一片绿色,有像萤火虫一样不停闪烁的细胞,点击之后可以弹射Cyto,利用这个原理来完成关卡。三个世界各有特色,利用的原理有都不一样,大大的增加了游戏的可玩性与挑战性。
除了这些奇妙的世界特性之外,各种障碍物和陷阱自然是少不了的。比如红色的带刺细胞、大型细胞被感染之后长出的红刺等等。但这些麻烦还远远不够,开发商还加入了一些限制,比如说如果你在一定时间内没有收集到记忆碎片,那么这个记忆碎片就会消失,而那些烦人的红细胞也会不断增加。这无疑是雪上加霜啊,游戏本身难度就很大,再有时间的限制那挑战性就更强了,还好不是每个关卡都有限制。